Le deuxième terminal à conteneurs de Mombasa sera édifié avec l’aide de capitaux japonais. Il sera financé par un prêt de la Kenya Port Authority (KPA) de 228,5 M$ (155,88 M€) auprès de la Japan Bank International Corporation, portant à 1,8 Md$ (1,23 Md€) le montant total emprunté par le Kenya à l’Agence japonaise de développement.
Ce terminal, situé à 1 km du premier, sera réalisé par des entreprises japonaises en trois phases pour obtenir à terme une capacité de 1,2 MEVP. Les travaux incluent le dragage du chenal, l’élargissement du bassin de giration et la construction d’une nouvelle route d’accès. Selon KPA, le trafic du terminal gagne 12 % chaque année tandis que les conteneurs représentent 70 % du trafic total du port. Ses trois postes à quai lui ont permis un trafic de 436 000 EVP en 2005 qui pourrait passer à 1 MEVP en 2015.