Le 5 juin, la direction et les syndicats ont signé un protocole de fin de conflit relatif à l'organisation de l'armement. Quelques jours plus tôt, la perspective de transférer la gestion des équipages français à Marseille, où se trouve la direction de la compagnie, avait suscité bien des émotions et un appel à la grève (voir JMM du 5 juin, p. 7).
Toujours est-il que l'avenant du 5 juin à l'accord de septembre 2007, concernant le transfert des salariés au sein de CMA Ships, confirme l'organisation de l'armement : le directeur sera basé à Marseille ; le capitaine d'armement, adjoint au directeur, restera basé au Havre ainsi que le responsable du service planification, « placé sous la responsabilité du capitaine d'armement, par délégation ». « Les engagements sociaux, et en particulier le maintien de l'emploi sur le site d'affectation initial » sont également confirmés. « Il est précisé que les postes de directeur de l'armement et de capitaine d'armement sont occupés par des officiers navigant inscrits aux cadres CMA CGM, détachés à terre, ayant occupé des fonctions de capitaine et/ou de chef mécanicien ». M.N.