Le port de Zeebrugge compte actuellement deux grands terminaux à conteneurs et un troisième plus petit axé sur le shortsea. Un autre grand terminal, en cours d’aménagement, sera opérationnel début 2010. Tous se situent dans l’avant-port à marée, ce qui assure les armements d’un accès direct et rapide à la haute mer. Zeebrugge, qui était un port essentiellement dominé par le ro-ro a désormais la conteneurisation en manutention verticale comme premier secteur de trafic et principal animateur de croissance. Sur les 13 Mt de trafic roulier en 2007, les conteneurs ont représenté 9,84 Mt (803 000 EVP) pour les ferries. Les terminaux à conteneurs sont intervenus avec 10,66 Mt (1 228 000 EVP + 34,42 %). Cette tendance va s’accentuer.
Le principal manutentionnaire est et restera du moins dans un avenir prévisible PSA/HNN. Il exploite le terminel CHZ (Container Handling Zeebrugge), qui présente la forme d’une presqu’île bordée d’un côté d’un quai de 1 000 m (profondeur d’eau 15 m) où sont traités des porte-conteneurs océaniques jusqu’à 9 500 EVP avec 8 portiques, soit 3 pouvant couvrir jusqu’à 21 EVP en largeur de pontée, 3 couvrant 18 EVP et 2 couvrant 14 EVP. De l’autre côté, un quai de 750 m où sont traités barges et feeders tandis que sur le quai un faisceau de voies de 650 m surmonté de deux nouveaux portiques permettant également de charger et décharger des trains-blocs. La superficie du site est de 37,5 ha susceptible d’être portée à 40 ha. Des prises reefer peuvent accueillir jusqu’à 250 conteneurs. La capacité de ce terminal est de l’ordre de 850 000/900 000 EVP. À l’issue du premier semestre le terminal avait manutentionné 300 000 EVP en maritime et fluvio-maritime. Les rendements vont de 29 à 35 conteneurs par heure/portique. Sont notamment traités les services Europe-Asie de CMA CGM, CSCL, et d’Evergreen.
PSA/HNN procède par ailleurs à l’aménagement d’un second terminal dans la darse Albert II, qui dans une première phase disposera d’un quai de 700 m parcouru par 5 portiques super-post-panamax couvrant jusqu’à 24 EVP en largeur de pontée et qui seront équipés de spreaders pour Tandem lift (2 × 40’). Le rail sera présent sur site. Ce terminal sera opérationnel en mars 2010. Sa cxpacité initiale sera de l’ordre de 1 000 000 EVP. Par la suite le quai sera porté à 1 400 m et d’autres portiques interviendront.