La Commission européenne a présenté ses propositions pour le financement de projets RTE-T durant la période 2007-2013. Dans son choix, la Commission a donné la priorité aux projets transfrontaliers et aux modes de transport respectueux de l’environnement tels que les voies navigables et le rail. Suite à la publication de quatre appels de propositions, la Commission a reçu 221 dossiers. Le montant de ces demandes de soutien (plus de 11,5 Md€) dépassait de loin le budget communautaire disponible, soit 5,1 Md€.
Les projets sélectionnés satisfont également aux objectifs de la Commission en ce qui concerne le développement durable du transport. La Commission envisage d’accorder le financement le plus important possible à des projets dans le secteur des voies navigables. Le budget total alloué à ce type de projets s’élève à 11,5 % du total des ressources disponibles pour les 30 projets prioritaires, tandis que la part du rail est de 74,2 %.
Les projets bénéficiant d’un soutien important sont notamment: la liaison à grande vitesse entre Lisbonne et Madrid (Evora-Merida), l’axe ferroviaire "Rail Baltica" ", des études pour la liaison "Trieste – Divaãa" entre la Slovénie et l’Italie, la liaison fixe rail/route du Fehmarn Belt, les traversées ferroviaires alpines du Brenner et du Mont Cenis, la liaison fluviale Seine-Escaut et le développement du Danube. Par ailleurs, la Commission a sélectionné des propositions relatives au système européen de gestion du trafic ferroviaire (ERTMS), au système de transport intelligent (ITS) et à la gestion du trafic aérien (ATM).
Outre le programme pluriannuel, la Commission a également sélectionné plusieurs projets dans le cadre du programme RTE-T pour l’année 2007. Ce programme, étant annuel, complète le programme pluriannuel en y apportant un grand degré de souplesse pour faire face aux besoins nouveaux. Pour ce programme annuel, le total du soutien demandé – soit 945 M€ – dépassait largement les 112 M€ disponibles dans le budget communautaire.