Ingénieur en chef des ponts, des eaux et des forêts, Marc Papinutti a été nommé à la direction des VNF par décret du président de la République.
Il était précédemment directeur des infrastructures de Transport au sein du ministère de l'Ecologie.
La direction des VNF se partage entre un président du conseil d'administration chargé des orientations stratégiques - poste actuellement occupé par Alain Gest - et un directeur général en charge de l'exécutif.
L'organisme public est notamment le maître d'ouvrage du canal Seine-Nord Europe, un projet de plus de 4 milliards d'euros destiné à combler l'absence de liaison à grand gabarit entre la Seine et l'important réseau fluvial de l'Europe du Nord.